Kirurgisk klinikk har 1 operasjonsstue i Bevegelsesenteret, 1 stue i Kvinne-barn-senteret, 3 stuer i Akutt-Hjerte-Lungesenteret og 7 operasjonsstuer i Gastrosenteret. Operasjonsavdelingen er inndelt i de seks seksjonene gastro, uro, barn og kar-/ endokrin-/ plastikkirurgi.