Doktorgradsprøve mandag 17. desember kl. 12.15 i auditoriet Laboratoriesenteret, St. Olav, for graden PhD i molekylær medisin med avhandlingen "Betydningen av enteropatogen Escherichia coli for diare hos barn i Norge". Prøveforelesning er samme dag og sted kl. 10.15.
Bakgrunn: Enteropatogen E. coli (EPEC) er en av flere varianter av tarmbakterien E. coli som kan gi diaré. Tradisjonelt deles EPEC inn i to grupper: typisk og atypisk EPEC. Typisk EPEC er kjent for å gi alvorlig spedbarnsdiaré i U-land. Det har imidlertid vært usikkert i hvilken grad atypisk EPEC forårsaker diarésykdom.
Mål: Formålet med denne studien var å undersøke hvor hyppig EPEC finnes og om denne typen bakterier er assosiert med diarésykdom hos barn i Norge.
Materiale og metoder: Forekomsten av EPEC ble undersøkt i et laboratoriebasert materiale fra barn med diaré mindre enn 2 år i Sør-Trøndelag. Deretter gjennomførte vi en kasus kontroll-studie blant barn < 5 år. Kasus var barn med diaré hvor avføringsprøve ble sendt til laboratoriet, mens friske kontroller ble rekruttert via helsestasjoner. EPEC ble diagnostisert med genteknologisk metodikk (PCR). Bakterieisolatene ble deretter undersøkt med både serotyping og flere genotypiske metoder inkludert mikromatrisemetodikk og multilokus sekvenstyping.
Resultater: EPEC ble funnet hos 10-15% av barn med diaré og hos 10 % av friske barn. Majoriteten av EPEC-bakteriestammene ble klassifisert som atypisk EPEC, og ble både ved serotyping og multilokus sekvenstyping funnet å være svært heterogene. Sju gener ble ved bruk av mikromatrisemetodikk funnet å være positivt statistisk assosiert med diaré. Assosiasjonen var sterkest for genet efa1/lifA. Sterk negativ assosiasjon med diaré ble påvist for genet yjaA. Basert på forekomsten av de virulensgenene som var postitivt og negativt assosiert med diaré, kunne bakterieisolatene klassifiseres i to virulensgrupper. Gruppen av atypisk EPEC som hadde gener assosiert med diaré finnes både hos barn med kortvarig og langvarig diarésykdom. Gruppen av bakterieisolater med gener negativt assosiert med diaré, er trolig kolonisatorer som ikke gir sykdom.
Konklusjon: EPEC, hovedsakelig atypisk EPEC, er vanlig hos barn både med og uten diaré i Norge. Basert på kartlegging av bakteriegener fant vi to grupper atypisk EPEC. Kun en av disse var statistisk assosiert med diarésykdom.
Navn kandidat: Jan Egil Afset
Institutt: Institutt for laboratoriemedisin, barne- og kvinnesykdommer
Veileder(e): Kåre Bergh (hovedveileder) og Lars Solbu Bevanger (biveileder)
Finansieringskilde: Samarbeidsorganet mellom Helse Midt-Norge RHF og NTNU
For mer informasjon