Open source software for medisinsk forskning

Programvarene nedenfor er utviklet ved SINTEF Medisinsk teknologi i samarbeid med St. Olavs hospital og er tilgjengelige under åpne lisenser. De er ment for bruk i klinisk forskning og er ikke godkjent for rutinemessig klinisk bruk.

Fraxinus er en åpen forskningsplattform for preoperativ planlegging og simulering ved bronkoskopi. Systemet guider brukeren gjennom fire steg: import av CT-data, automatisk segmentering av luftveier og omliggende strukturer, ruteplanlegging til mållesjon, og prosedyreøvelse via virtuell bronkoskopi og EBUS-simulering.

Plattformen er utviklet av SINTEF Medisinsk teknologi i samarbeid med St. Olavs hospital og bygger på CustusX-rammeverket. Prosjektet har mottatt støtte fra Norges forskningsråd og flere EU-prosjekter.

Fraxinus er et forskningsverktøy og er ikke godkjent for rutinemessig klinisk bruk (ikke FDA- eller CE-merket).

Fraxinus nettside  Last ned (GitLab)  GitHub (speil)  Brukerdokumentasjon

CustusX er et åpent navigasjonssystem for bildeveiledede inngrep, utviklet ved det Nasjonale kompetansesenteret for ultralyd og bildeveiledет terapi (USIGT) ved SINTEF og St. Olavs hospital. Systemet integrerer og visualiserer informasjon fra flere modaliteter – CT, MR, fluoroskopi og ultralyd – og er spesielt rettet mot intraoperativ bruk med fokus på sanntidsstyring av kirurgiske instrumenter.

Plattformen er benyttet innen nevrokirurgi, laparoskopisk kirurgi, karkirurgi, intervensjonsradiologi og bronkoskopi, og fungerer både som et ferdig navigasjonssystem og som rammeverk for å bygge spesialtilpassede forskningsapplikasjoner. Andre applikasjoner bygget på CustusX inkluderer Fraxinus og NorMIT-Nav.

CustusX er et forskningsverktøy og er ikke godkjent for rutinemessig klinisk bruk (ikke FDA- eller CE-merket).

CustusX nettside Last ned (GitLab) Videodemonstrasjoner (YouTube) Brukerdokumentasjon

Raidionics er en åpen programvareplattform for analyse og visualisering av nevrologiske MR-bilder. Systemet støtter automatisk segmentering av de vanligste typene hjernesvulster – glioblastom, diffust lavgradig gliom, meningeom og metastaser – både preoperativt og postoperativt.

I tillegg til segmentering tilbyr Raidionics standardisert RADS-rapportering: volum, diameter, multifokalitet, lateralitet og tumorens beliggenhet i forhold til kortikale og subkortikale strukturer. Kirurgisk rapportering inkluderer reseksjonsgrad etter RANO 2.0-retningslinjene. Modellene er trent på pasientdata fra St. Olavs hospital og en rekke internasjonale partnersykehus.

Raidionics nettside Last ned (Windows) GitHub Dokumentason (Wiki) 

Vitenskapelige publikasjoner

Referanser og sitering

Dersom du bruker disse verktøyene i vitenskapelig arbeid, ber vi deg sitere følgende publikasjoner: